clusterProfiler的GO与KEGG功能有哪些

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支持的20个模式物种列表如下：

简单总结clusterProfiler包进行GO、KEGG的富集分析方法，结果输出及内置的图形展示。

#安装富集分析需要的包
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("enrichplot")
BiocManager::install("GSEABase")
BiocManager::install("pathview")
BiocManager::install("clusterProfiler")
#20个模式物种注释文件：https://www.亿速云.com/article/1244
BiocManager::install("org.Hs.eg.db")
#非模式物种需要的包
BiocManager::install("AnnotationHub")
BiocManager::install("biomaRt")

#######加载必要的包#####################################################
library(clusterProfiler)
library(pathview)
library(GSEABase)
library(enrichplot)
#模式物种
library(AnnotationHub)
library(biomaRt)
############################################################

以上就是关于“clusterProfiler的GO与KEGG功能有哪些”这篇文章的内容，相信大家都有了一定的了解，希望小编分享的内容对大家有帮助，若想了解更多相关的知识内容，请关注亿速云行业资讯频道。