在PHP中处理时间戳毫秒的性能问题通常涉及到以下几个方面：
时间戳精度：PHP的time()函数返回的时间戳精度是秒级的，如果需要毫秒级的精度，可以使用microtime()函数。但是需要注意的是，microtime()返回的时间戳格式是以秒和微秒表示的，需要进行相应的处理才能获取毫秒部分。
时间戳计算：在进行时间戳计算时，需要考虑到毫秒级的精度，避免精度丢失导致计算结果不准确。可以使用DateTime类或者相关的时间处理函数来进行时间戳计算。
性能优化：如果需要处理大量的时间戳毫秒数据，可以考虑使用缓存或者优化算法来提升处理性能。同时，避免频繁地进行时间戳转换和计算操作，可以将结果缓存起来以减少重复计算。
总的来说，处理时间戳毫秒的性能问题主要在于对时间戳精度的处理和时间戳计算的准确性，通过合理设计和优化可以有效提升处理性能。