VPS传网站程序的方法通常有以下几种：
使用FTP客户端：通过FTP客户端软件（如FileZilla、WinSCP等），将网站程序的文件和文件夹从本地计算机上传到VPS上。首先需要在VPS上安装一个FTP服务器软件（如vsftpd、ProFTPD等），并配置好FTP服务器的用户名、密码以及访问目录。
使用SSH（Secure Shell）：通过SSH协议连接到VPS的命令行界面，然后使用SCP（Secure Copy）命令将网站程序的文件和文件夹从本地计算机复制到VPS上。这种方法相对于FTP更加安全，但需要对SSH有一定的了解和操作能力。
使用网页控制面板：如果你的VPS提供商提供了网页控制面板（如cPanel、Plesk等），你可以直接在控制面板中上传和管理网站程序的文件。这种方法适合那些不熟悉命令行和FTP的用户。
使用版本控制工具：如果你使用的是版本控制系统（如Git），你可以将网站程序的代码托管到代码仓库中，然后在VPS上通过Git客户端将代码克隆到VPS上。这种方法适用于团队协作开发或者需要频繁更新和部署网站程序的情况。
以上是一些常见的VPS传网站程序的方法，具体选择哪种方法取决于你的需求和熟悉程度。