在Linux环境中，管理环境变量的最佳方法是通过配置文件来设置和管理环境变量。以下是一些常用的方法：
在用户的主目录下的.bashrc或者.zshrc文件中设置环境变量。这样可以保证每次用户登录时环境变量都会被加载。
在/etc/profile或/etc/profile.d目录中设置系统范围的环境变量。这样可以确保所有用户都可以访问到这些环境变量。
使用export命令来设置环境变量。例如，可以使用export PATH=$PATH:/myapp/bin来将新目录添加到PATH环境变量中。
使用source命令来重新加载配置文件，以确保修改的环境变量立即生效。例如，可以使用source ~/.bashrc来重新加载用户的.bashrc文件。
使用专门的环境变量管理工具，如direnv，来管理项目特定的环境变量。这些工具可以根据当前目录的情况自动加载和卸载环境变量。
总的来说，使用配置文件来设置和管理环境变量是最佳的方法，可以确保环境变量的一致性和可维护性。同时，建议使用专门的工具来管理项目特定的环境变量，以提高开发效率和项目可移植性。