在Debian系统中进行PHP安全性检查，可以采取以下几种方法：
使用OSV-Scanner： OSV-Scanner是一个开源工具，用于查找项目依赖项中的现有漏洞。它支持多种语言和包管理器的锁文件，可以自动检测并报告已知的安全问题。
配置防火墙： 配置防火墙以限制对PHP服务的访问，只允许必要的端口（如HTTP、HTTPS和SSH）连接，拒绝所有其他未授权的入站连接请求。
更新系统及软件包： 定期更新PHP和所有相关的软件包，以确保使用的是最新的安全补丁和功能。
限制root用户权限： 避免使用root账户进行PHP操作，创建具有sudo权限的普通用户，以减少潜在的安全风险。
配置PHP-FPM：
合理配置PHP-FPM（FastCGI Process Manager），例如设置pm.max_children来控制并发进程数，以及启用适当的错误报告级别，避免泄露敏感信息。
代码审查： 对PHP代码进行手动审查，检查潜在的安全问题，如SQL注入、跨站脚本攻击（XSS）、文件包含漏洞等。
使用安全编码实践：
遵循安全编码的最佳实践，如使用预pared语句防止SQL注入，对用户输入进行严格的验证和过滤，避免使用不安全的函数如eval()和exec()等。
定期进行安全审计：
使用工具如phpcs进行代码风格检查，以及进行渗透测试来发现潜在的安全漏洞。
监控和日志记录： 配置日志记录以监控PHP错误和其他重要事件，确保可以快速响应任何异常行为。
通过上述方法，可以显著提高Debian系统中PHP应用的安全性。建议定期进行安全审计和更新，以应对不断变化的安全威胁。