防止网站域名被劫持的方法：1、为域名注册商和注册邮箱设置复杂密码，并经常更换，注意不要使用相同的用户名和密码；2、定期检查域名帐户信息和域名whois信息，清理Web网点中存在的可疑文件；3、配置Web站点文件夹和文件操作权限；4、将域名更新设置为锁定状态，不允许通过DNS服务商网站修改记录；5、删除运行在DNS服务器上的不必要服务；6、加强网站的防SQL注入功能；7、对区域传送和区域更新进行数字签名；8、在网络外围和DNS服务器上使用防火墙服务。
具体内容如下：
1、为域名注册商和注册用邮箱设置复杂密码且经常更换。使用单独的DNS服务，也需要对密码进行上述设置。同时注意不要在多个重要注册地使用相同的用户名和密码。
2、定期检查域名帐户信息、域名whois信息，査看事件管理器，清理Web网点中存在的可疑文件。每天site网站检查是否有预期外网页。详细检查网站索引和外链信息有异常一定要检查清楚。
3、配置Web站点文件夹及文件操作权限。Windows网络操作系统中，使用超级管理员权限， 对Web站点文件及文件夹配置权限，多数设置为读权限，谨慎使用写权限，如果无法获取超级管理员权限，这样木马程序便无法生根，网站域名被劫持的可能便可以降低很多。
4、将域名更新设置为锁定状态，不允许通过DNS服务商网站修改记录，使用此方法后，需要做域名解析都要通过服务商来完成，时效性较差。
5、删除运行在DNS服务器上的不必要服务，如FTP。
6、加强网站的防SQL注入功能，SQL注入是利用SQL语句的特点向数据库写内容，从而获取到权限的方法。
7、利用事务签名对区域传送和区域更新进行数字签名。
8、在网络外围和DNS服务器上使用防火墙服务。将访问限制在那些DNS功能需要的端口/服务上。