PHP打包工具的安全性问题主要包括以下几点：
代码注入：恶意用户可以在打包过程中注入恶意代码，从而导致安全漏洞或数据泄露。
依赖安全性：打包工具可能会自动包含不安全或过期的依赖库，从而引发安全风险。
文件夹遍历：恶意用户可能会利用漏洞实现文件夹遍历，访问敏感文件或目录。
为了提高PHP打包工具的安全性，可以采取以下防范措施：
使用官方渠道下载打包工具，并定期更新到最新版本，以获取安全补丁和修复漏洞。
对打包工具进行安全审查，确保其来源可信，并注意查看用户评价和反馈。
在打包前进行代码审查，确保代码没有恶意注入或其他安全问题。
使用安全的依赖包管理工具，例如Composer，以确保依赖库的安全性和更新性。
避免在打包过程中包含敏感信息，如密码、密钥等，进行敏感信息加密或加密传输。
使用安全的云存储或私有存储，避免将打包文件存储在公共位置，以防止非法访问。
定期进行安全测试和漏洞扫描，及时发现并修复潜在的安全问题。