开发效率：jQuery Mobile是一个基于jQuery的移动应用开发框架，提供了丰富的UI组件和事件处理功能，可以快速开发移动应用。相比之下，原生JS需要手动编写大量代码来实现相同的功能，开发效率相对较低。
跨平台兼容性：jQuery Mobile可以跨多个平台和设备运行，并提供了一致的用户体验。而原生JS需要针对不同平台和设备进行定制开发，兼容性较差。
性能优化：jQuery Mobile提供了一些性能优化的功能，如页面的懒加载、缓存和动画效果的优化，可以提升应用的性能。而原生JS需要开发人员手动进行性能优化，较为繁琐。
生态系统：jQuery Mobile有一个庞大的生态系统，包括丰富的插件和扩展，可以帮助开发人员快速解决问题。而原生JS的生态系统相对较小，需要自行解决各种问题。
总的来说，jQuery Mobile适合快速开发移动应用和跨平台开发，而原生JS适合对性能和细节要求较高的项目。开发人员可以根据项目需求选择合适的技术来开发应用。