当Linux目录中的文件句柄失效时，可以尝试以下几种处理方法：
重新启动进程：如果文件句柄失效是由于进程打开的文件句柄过多导致的，可以尝试重新启动进程。通过终止进程然后重新启动，可以清理掉所有的文件句柄。
关闭不必要的文件句柄：可以通过查看进程的文件句柄列表，关闭不必要的文件句柄。可以使用lsof命令来查看进程打开的文件句柄，并使用fclose()或close()函数来关闭文件句柄。
增加文件句柄限制：Linux系统对每个进程打开的文件句柄数量有限制。可以通过修改系统内核参数或者使用ulimit命令来增加文件句柄限制。增加文件句柄限制可以使得进程能够打开更多的文件句柄。
重新挂载文件系统：如果文件句柄失效是由于文件系统出现问题导致的，可以尝试重新挂载文件系统。使用umount命令卸载文件系统，然后使用mount命令重新挂载文件系统。
检查硬件故障：如果以上方法仍然无法解决问题，可能是硬件故障导致的文件句柄失效。可以通过检查硬盘、内存等硬件设备的状态来确定是否存在硬件故障，并进行修复或更换硬件设备。