在Debian系统中选择MongoDB版本时，可以参考以下几个方面：
对于生产环境，选择长期支持（LTS）版本是比较保险的选择，这些版本经过更全面的测试并提供更长的支持周期。
不同版本的MongoDB可能会有一些新增的功能或者性能优化，根据自己的需求选择合适的版本。
及时更新安全补丁是保障系统安全的重要措施。
考虑现有系统的兼容性，选择与现有环境兼容的MongoDB版本。
截至撰写本文时，MongoDB的当前推荐版本是5.0。该版本引入了许多新特性，包括事务、聚合管道优化和增强的数据安全。
请注意，以上信息提供了在Debian系统上安装和配置MongoDB的一般性指导。具体版本的选择和安装步骤可能会随着MongoDB版本的更新和Debian系统的变化而有所不同。建议参考MongoDB官方文档以获取最新和最准确的信息。