在Ubuntu系统中，如果Java应用程序的日志中出现数据库连接问题，可以按照以下步骤进行排查：
检查数据库服务状态： 确保数据库服务正在运行。例如，如果你使用的是MySQL，可以使用以下命令检查其状态：
sudo systemctl status mysql
如果服务未运行，可以使用以下命令启动它：
sudo systemctl start mysql
检查数据库连接配置：
确认Java应用程序中的数据库连接配置是否正确。这包括数据库的URL、用户名、密码以及端口号。检查application.properties或application.yml文件中的配置项。
查看数据库日志：
数据库自身也有日志文件，可以查看这些日志以获取更多关于连接问题的信息。例如，对于MySQL，可以在/var/log/mysql/error.log中找到错误日志。
检查防火墙设置：
确保没有防火墙规则阻止了Java应用程序与数据库之间的通信。可以使用ufw命令来检查和修改防火墙规则。
测试数据库连接：
使用命令行工具（如mysql命令）或图形化工具（如MySQL Workbench）尝试手动连接到数据库，以确保可以从Ubuntu系统连接到数据库服务器。
检查网络连接：
确保Java应用程序所在的Ubuntu系统可以访问数据库服务器。可以使用ping命令来测试网络连接。
查看Java应用程序日志： 仔细阅读Java应用程序的日志文件，查找与数据库连接相关的错误信息。这些信息通常会指出问题的具体原因，例如连接超时、认证失败等。
检查数据库连接池配置： 如果Java应用程序使用了数据库连接池（如HikariCP、C3P0等），请检查连接池的配置是否正确，包括最大连接数、连接超时时间等。
更新依赖库： 确保Java应用程序使用的数据库驱动程序是最新的，并且与数据库服务器版本兼容。
重启服务： 在进行了上述更改后，重启Java应用程序和数据库服务，以确保所有更改生效。
通过以上步骤，你应该能够定位并解决Ubuntu系统中Java应用程序的数据库连接问题。如果问题仍然存在，可能需要更深入地分析日志文件或寻求专业的技术支持。