在Debian系统中，可以通过以下方法限制环境变量的使用：
使用/etc/environment文件：
/etc/environment文件是一个系统级的环境变量配置文件，它会在系统启动时被加载。在这个文件中定义的环境变量将对所有用户生效。要限制环境变量的使用，只需编辑此文件，删除或注释掉不需要的内存变量即可。
例如，要删除PATH环境变量中的某个路径，可以将该行修改为：
PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin"
使用/etc/profile和~/.profile文件：
/etc/profile文件是一个全局的环境变量配置文件，它在用户登录时被加载。~/.profile文件是一个用户级的环境变量配置文件，它在用户登录时也会被加载。这两个文件可以用来设置或修改环境变量。
要限制环境变量的使用，可以在这些文件中删除或注释掉不需要的内存变量。例如，要删除PATH环境变量中的某个路径，可以将该行修改为：
export PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin"
使用/etc/security/limits.conf文件：
/etc/security/limits.conf文件允许你为用户或用户组设置资源限制。虽然这个文件主要用于限制CPU、内存等资源的使用，但它也可以用来限制环境变量的使用。
要限制环境变量的使用，可以在这个文件中添加如下行：
username soft env_var_name value
username hard env_var_name value
其中，username是要限制的用户，env_var_name是要限制的环境变量名，value是限制的值。例如，要限制用户john的PATH环境变量，可以添加如下行：
john soft PATH "/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin"
john hard PATH "/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin"
使用pam_env模块：
pam_env模块允许你在PAM（Pluggable Authentication Modules）配置中使用环境变量。要限制环境变量的使用，可以在/etc/pam.d目录下的相关配置文件中添加或修改如下行：
session required pam_env.so readenv=1 envfile=/etc/environment
这将使得PAM在用户登录时读取/etc/environment文件，并将其作为环境变量设置。然后，你可以按照前面的方法编辑/etc/environment文件来限制环境变量的使用。
请注意，限制环境变量的使用可能会影响到系统的正常运行和某些应用程序的功能。在进行更改之前，请确保了解这些更改的影响，并在必要时备份相关文件。