在Debian上编译多模块Java项目，你可以使用Maven或Gradle这样的构建工具。以下是使用这两种工具的基本步骤：
安装Maven： 如果你还没有安装Maven，请先安装它。可以使用以下命令来安装：
sudo apt update
sudo apt install maven
创建Maven项目：
如果你的项目还没有创建，可以使用Maven的archetype:generate命令来创建一个新的多模块项目。
mvn archetype:generate -DgroupId=com.example -DartifactId=my-multi-module-project -DarchetypeArtifactId=maven-archetype-quickstart -DinteractiveMode=false
这将创建一个包含多个模块的项目结构。
配置模块：
在项目的根目录下，你会找到一个pom.xml文件，这是父POM文件。你需要在这个文件中定义所有的子模块。
<modules>
<module>module1</module>
<module>module2</module>
<!-- 其他模块 -->
</modules>
每个子模块也应该有自己的pom.xml文件。
编译项目： 在项目的根目录下，运行以下命令来编译整个项目：
mvn clean install
这将会编译所有的模块，并且如果有测试的话，还会运行测试。
安装Gradle： 如果你还没有安装Gradle，请先安装它。可以使用以下命令来安装：
sudo apt update
sudo apt install gradle
创建Gradle项目：
如果你的项目还没有创建，可以使用Gradle的init任务来创建一个新的多模块项目。
gradle init --type java-application
按照提示操作，选择多模块项目结构。
配置模块：
在项目的根目录下，你会找到一个settings.gradle文件，这是Gradle设置文件。你需要在这个文件中包含所有的子模块。
include 'module1', 'module2' // 其他模块
每个子模块也应该有自己的build.gradle文件。
编译项目： 在项目的根目录下，运行以下命令来编译整个项目：
gradle build
这将会编译所有的模块，并且如果有测试的话，还会运行测试。
确保你的Debian系统已经安装了Java Development Kit (JDK)，因为Maven和Gradle都需要它来编译Java项目。你可以使用以下命令来安装OpenJDK：
sudo apt install openjdk-11-jdk
以上步骤假设你已经有了一个多模块的Java项目。如果你是从头开始创建一个新项目，你需要先设计你的模块结构，然后按照上述步骤来初始化和构建你的项目。