是的，FTP服务器可以配置多个域名进行绑定。通过在FTP服务器的配置文件中添加多个域名和相应的目录路径，可以实现多个域名指向同一个FTP服务器的不同目录，实现多个域名的绑定。这样用户可以通过不同的域名访问同一个FTP服务器，方便管理和访问文件。