Ubuntu上MongoDB数据如何恢复 - 问答

Ubuntu 上 MongoDB 数据恢复指南

一场景与准备

明确备份类型：
- 逻辑备份（由 mongodump 生成，目录内含 .bson 与 .metadata.json 文件），适合跨版本迁移与库/集合级恢复。
- 物理备份（拷贝 WiredTiger 数据目录等），适合同版本、同存储引擎的快速恢复。
版本与工具兼容：恢复工具的版本需与目标 MongoDB 版本匹配，避免 mongorestore 不兼容导致失败。
权限与服务：准备好具有相应权限的账号（常见为 admin 库用户），并确认 mongod 服务可正常启动。
目标环境：确保目标机器的 Ubuntu、存储路径、端口与资源配置满足恢复需求。

二使用 mongorestore 恢复逻辑备份（最常见）

基本步骤
1. 安装与备份一致版本的 MongoDB（含 mongorestore）。
2. 如在生产环境操作，建议先停写或切换到维护窗口，必要时对现有数据做逻辑备份：
  - 停止服务：sudo systemctl stop mongod
  - 备份现有数据：mongodump --out /path/to/backup/folder
3. 执行恢复（示例）：
  - 恢复整个数据库目录：
    mongorestore --uri='mongodb://127.0.0.1:27017/?authSource=admin' /path/to/backup/folder
  - 恢复单库：
    mongorestore --uri='mongodb://127.0.0.1:27017/?authSource=admin' --db mydb /path/to/backup/folder/mydb
  - 恢复单表：
    mongorestore --uri='mongodb://127.0.0.1:27017/?authSource=admin' --db mydb --collection mycol /path/to/backup/folder/mydb/mycol.bson
  - 覆盖写入（谨慎）：在命令中加入 –drop，先删除同名集合再恢复。
4. 启动服务并校验：
  - 启动：sudo systemctl start mongod
  - 校验：mongo --host 127.0.0.1 -u <user> -p <pwd> --authenticationDatabase admin，在 shell 中执行 show dbs、use <db>、db.<col>.countDocuments({})。
常见要点
- 认证库通常为 admin，请在 URI 中使用 ?authSource=admin。
- 分片集群的云盘逻辑备份解压后不含路由信息，可恢复到任意单节点/副本集/分片架构，但分片需自行预分片。
- 若下载的备份被切分为多个 .bson 分片，需先合并再恢复（见下文“分片 bson 合并”脚本）。

三分片备份的 bson 合并与恢复

现象：下载的库表目录中，集合数据可能被拆成多个 data/*.bson 分片（如：myCollection_0_part0.bson）。mongorestore 会受文件名前缀影响，直接恢复可能失败或重复。
处理思路：将同一集合的多个 .bson 合并为一个，再恢复。

合并脚本（Python 3，保存为 merge_bson_files.py）：

import os, shutil

def merge_bson_dir(input_dir: str, output_dir: str):
    for root, dirs, files in os.walk(input_dir):
        for f in files:
            if f.endswith('.bson') and not f.endswith('.metadata.json'):
                rel = os.path.relpath(root, input_dir)
                ns = rel.replace(os.sep, '.')            # db.collection
                out_dir = os.path.join(output_dir, rel)
                os.makedirs(out_dir, exist_ok=True)
                out_file = os.path.join(out_dir, f"{ns}.bson")
                with open(out_file, 'ab') as of:
                    with open(os.path.join(root, f), 'rb') as inf:
                        shutil.copyfileobj(inf, of)
                # 复制元数据
                meta = os.path.join(root, f"{f}.metadata.json")
                if os.path.exists(meta):
                    shutil.copy2(meta, os.path.join(out_dir, f"{ns}.bson.metadata.json"))

if __name__ == '__main__':
    import argparse
    p = argparse.ArgumentParser()
    p.add_argument('input_root')
    p.add_argument('-o', '--output_root', default=None)
    args = p.parse_args()
    merge_bson_files_dir(args.input_root, args.output_root or args.input_root)

使用方式：
- 合并：python3 merge_bson_files.py /path/to/backup/folder -o /path/to/merged
- 恢复：mongorestore --uri='mongodb://127.0.0.1:27017/?authSource=admin' /path/to/merged
说明：空表也会生成包含库表名的空 .bson，可直接被 mongorestore 处理。

四物理备份恢复 WiredTiger 数据目录（同版本）

适用：同版本、同存储引擎（如 WiredTiger）的物理恢复，常用于整机/目录级灾难恢复。
基本步骤
1. 安装与目标实例版本一致的 MongoDB。
2. 准备配置文件（示例，存储引擎为 WiredTiger）：
```
systemLog:
  destination: file
  path: /test/mongo/mongod.log
  logAppend: true
security:
  authorization: enabled
storage:
  dbPath: /test/mongo/data
  directoryPerDB: true
net:
  port: 27017
  unixDomainSocket:
    enabled: false
processManagement:
  fork: true
  pidFilePath: /test/mongo/mongod.pid
```
3. 使用准备好的数据文件替换/放置到 dbPath（如 /test/mongo/data），确保文件属主与权限正确（如 mongodb:mongodb）。
4. 启动并检查：
  - 启动：mongod -f /test/mongo/mongod.conf
  - 校验：mongo --host 127.0.0.1 -u <user> -p <pwd> --authenticationDatabase admin，执行 show dbs 等。
重要限制
- 版本需严格匹配；存储引擎需一致（如 WiredTiger）。
- 如为 RocksDB 引擎，需使用带 RocksDB 编译的 MongoDB 版本。
- 副本集的物理备份可能带有原实例的副本集配置，需清理后再以副本集模式启动。

五常见问题与排错

版本不兼容：出现 “Unrecognized BSON type/Invalid BSON” 等，多为 mongorestore 版本过低，升级到与目标库一致的版本后重试。
认证失败：确认 –authenticationDatabase=admin 与账号权限；密码含特殊字符请用单引号包裹。
集合未恢复或重复：分片/并行导出的 .bson 未合并，按上文脚本合并后再恢复。
恢复后数据不一致：备份期间写入导致不一致，建议在低峰期执行，或使用复制集/事务机制提升一致性。
物理恢复启动失败：检查 dbPath 权限、目录是否为空、配置文件参数（如 directoryPerDB）、以及 WiredTiger 版本匹配。

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