在Eclipse中，断点调试结束有以下几种方式：
继续执行：在调试视图中，点击继续按钮（绿色的三角形按钮），程序会继续执行直到下一个断点或程序结束。
单步执行：在调试视图中，点击单步执行按钮（蓝色的一字箭头按钮），程序会逐行执行代码，可以通过单步执行、逐过程、逐出口等方式进行代码调试。
断点删除：在编辑器中，右键点击断点所在的行号，选择删除断点，断点会被移除。
中止调试：在调试视图中，点击终止按钮（红色的方形按钮），程序会立即停止执行。
正常停止：在程序执行完毕后，调试会自动结束，也可以手动点击停止按钮（红色的方形按钮）停止程序。
需要注意的是，在调试过程中，可以通过观察变量值、堆栈信息等来判断程序的执行状态，以及判断是否需要继续调试或结束调试。