在Slim框架项目中，通常推荐按照以下结构组织项目文件：
根目录：根目录下通常包含项目配置文件（如composer.json、.env等）、入口文件（通常是index.php）以及其他需要放在根目录下的文件。
app目录：该目录通常用于存放应用程序的核心代码，包括路由定义、中间件、控制器、服务提供者等。
routes目录：通常存放路由定义文件，可以根据需要将路由按功能或模块分割成多个文件。
middlewares目录：存放中间件文件。
controllers目录：存放控制器文件。
providers目录：存放服务提供者文件，用于注册服务到Slim容器中。
config目录：存放配置文件，如数据库配置、应用配置等。
public目录：存放公共资源文件，如CSS、JS、图片等。
views目录：存放视图文件，通常使用模板引擎（如Twig）来渲染视图。
storage目录：存放应用程序生成的临时文件、日志文件等。
这种结构可以根据项目的规模和需求进行调整和扩展，但保持良好的组织结构能够更好地管理项目代码和资源。