在Ubuntu系统中配置Compton以支持多屏显示，可以按照以下步骤进行：
首先，确保你已经安装了Compton。你可以使用包管理器来安装它。例如，在基于Debian的系统上，可以使用以下命令：
sudo apt-get update
sudo apt-get install compton
Compton的配置文件通常位于~/.config/compton.conf。如果这个文件不存在，你可以手动创建一个。你可以使用文本编辑器如nano或vim来创建和编辑配置文件：
nano ~/.config/compton.conf
在配置文件中，你可以使用xrandr命令的输出来指定哪些显示器应该被Compton管理。例如：
xrandr-output HDMI-1 eDP-1;
这里的HDMI-1和eDP-1是你显示器的名称，你可以通过运行xrandr命令来查看你的显示器名称。
配置文件准备好后，你可以通过命令行运行Compton：
compton -c ~/.config/compton.conf
如果你想要让Compton在启动时自动运行，你可以将它添加到你的窗口管理器的启动脚本中。例如，如果你使用的是i3窗口管理器，可以将以下内容添加到~/.config/i3/config.conf文件中：
exec --no-startup-id compton -c ~/.config/compton.conf
请注意，Compton的配置选项非常多，你可以根据自己的需求进行调整。上面的配置只是一个起点，你可能需要根据你的具体设置和需求进行调整。
如果你使用的是其他窗口管理器，请查阅相应的文档以了解如何添加Compton到启动脚本中。