Debian系统中的Apache HTTP Server的主要配置文件是/etc/apache2/apache2.conf。这个文件包含了Apache服务器的核心配置，如监听端口、模块加载等。
除了主配置文件apache2.conf之外，Debian系统还提供了用于配置虚拟主机的目录/etc/apache2/sites-available。在这个目录下，你可以找到为每个虚拟主机创建的配置文件，例如mydomain.com.conf。如果你想要启用某个虚拟主机配置，需要将其链接到/etc/apache2/sites-enabled目录下。
此外，Apache还有其他相关配置文件和目录，例如：
/etc/apache2/ports.conf：指定Apache监听的端口配置文件。/etc/apache2/sites-enabled：存储已启用的虚拟主机配置文件的目录，这些文件是通过a2ensite命令从/etc/apache2/sites-available目录链接过来的。/etc/apache2/mo：包含Apache模块的文件目录。