在Debian上部署JSP应用时，可能会遇到一些兼容性问题。以下是一些需要注意的关键点：
确保安装了兼容的Java版本。JSP应用通常需要Java Servlet容器（如Apache Tomcat）来运行，而Tomcat对Java版本有一定的要求。例如，Tomcat 9需要Java 8或更高版本。
选择合适的Tomcat版本。不同版本的Tomcat可能对JSP的支持程度不同，需要根据应用的需求选择合适的版本。同时，要确保Tomcat与Debian系统兼容，可以参考Tomcat官方文档中的系统要求。
检查并安装所有必要的依赖库。JSP应用可能依赖于一些Java库，这些库需要在部署前确保已经安装在Tomcat的lib目录下。
正确配置Tomcat的配置文件（如server.xml、context.xml等），以确保应用能够正确运行。特别是端口配置、SSL配置等。
确保应用文件和目录的权限设置正确。在Debian上，通常使用chown和chmod命令来设置文件和目录的所有者和权限。
配置日志和监控，以便在应用出现问题时能够快速定位和解决。Tomcat提供了详细的日志文件，可以通过配置日志级别来监控应用的运行情况。
注意应用的安全性，防止常见的安全漏洞，如文件下载漏洞等。可以通过配置安全策略、更新软件版本等方式来提高应用的安全性。
以上是在Debian上部署JSP应用时需要注意的一些兼容性问题。建议在部署前详细阅读相关软件的官方文档，并根据具体需求进行相应的配置和调整。