在Linux系统中，可通过SecureCRT软件界面或配置文件自定义主题，具体如下：
- 通过软件界面自定义：打开SecureCRT，点击“Options”，选择“Appearance”，在“Color Scheme”中可浏览预设主题，也可点击“Import”导入.clr格式的自定义主题文件。若要修改颜色方案，可在“Appearance”窗口中点击“Edit”进行设置，完成后点击“OK”保存，还可勾选“Use this color scheme as default”将其设为默认主题。
- 通过配置文件自定义：配置文件一般位于用户主目录下的.securecrt文件夹中，找到config.ini文件，用文本编辑器打开，在[ColorScheme]部分手动添加或修改颜色设置，如Background、Foreground等，保存后重启SecureCRT使更改生效。