C#混淆会对反射造成一定程度的影响。由于反射是在运行时对程序集进行分析和操作的过程，混淆可能会使反射操作变得更加困难。混淆工具通常会对程序集中的类、方法、变量等进行重命名或者重构，这会使反射过程中需要引用这些元素的代码无法找到它们。
因此，在使用混淆工具对程序集进行混淆时，开发人员需要特别注意反射操作的影响。可能需要在混淆前备份需要进行反射操作的代码，并在混淆后进行相应的调整以确保程序正常运行。另外，一些混淆工具也提供了针对反射的特殊处理选项，开发人员可以根据需要进行配置。