要清理宝塔数据库的缓存，可以按照以下步骤进行操作：
- 登录宝塔面板。
- 在左侧导航栏中找到并点击“数据库”选项。
- 在数据库列表中选择需要清理缓存的数据库，并点击右侧的“管理”按钮进入数据库管理页面。
- 在数据库管理页面中，点击顶部的“工具箱”选项卡。
- 在工具箱页面中，找到并点击“清理缓存”选项。
- 系统会弹出确认清理缓存的提示框，点击“确定”进行确认。
- 等待清理完成，系统会显示清理缓存的结果。
注意事项：
- 清理缓存操作可能会导致数据库连接中断，请确保在低峰期进行操作或提前通知相关人员。
- 清理缓存操作不可逆，一旦清理完成，无法恢复清理前的状态，请谨慎操作。