在使用Java中的substring()方法时，最佳实践是注意以下几点：
确保起始索引和终止索引在有效范围内：当使用substring()方法时，需要确保起始索引和终止索引在字符串的有效范围内，否则会抛出IndexOutOfBoundsException异常。
考虑使用substring()方法的重载方法：substring()方法有两种重载形式，一种是传入起始索引的substring(int beginIndex)，另一种是同时传入起始索引和终止索引的substring(int beginIndex, int endIndex)。根据需要选择合适的重载方法。
注意字符串索引从0开始：在Java中，字符串的索引是从0开始计数的，因此需要记住这一点，以避免出现错误的索引值。
谨慎处理负数索引：如果传入负数索引，substring()方法会将其视为字符串末尾的偏移量，因此需要谨慎处理负数索引的情况。
考虑使用String类的subSequence()方法：除了substring()方法外，String类还提供了subSequence()方法来获取子序列，可以根据具体需求选择合适的方法。
总之，正确使用substring()方法可以帮助我们更方便地操作字符串，但需要注意参数的合法性和边界情况，以确保程序的正确性和稳定性。