在Tomcat中，有多种方法可以进行配置：
1. 通过修改Tomcat的配置文件：Tomcat的主要配置文件是`server.xml`，可以通过修改这个文件来配置Tomcat的各种参数，如端口号、虚拟主机、连接池等。
2. 通过系统环境变量：可以通过设置系统环境变量来配置Tomcat的参数，如JAVA_OPTS变量可以用来设置JVM的参数。
3. 通过CATALINA_OPTS环境变量：可以通过设置CATALINA_OPTS环境变量来配置Tomcat的参数，如设置JVM的内存大小、GC算法等。
4. 通过web.xml文件：每个Web应用程序都有一个`web.xml`文件，可以在这个文件中配置特定于该应用程序的参数，如servlet、过滤器、监听器等。
5. 通过context.xml文件：每个Web应用程序的`META-INF`目录下都可以有一个`context.xml`文件，可以在这个文件中配置该应用程序的上下文参数，如数据库连接池、JNDI等。
6. 通过注解：可以使用注解来配置特定的Servlet、过滤器、监听器等，如使用`@WebServlet`注解来配置Servlet。
7. 通过JNDI：可以使用JNDI来配置Tomcat的资源，如数据库连接池、JMS连接等。
这些方法可以根据具体的需求来选择和组合使用。