在Java程序中，可以使用System.exit()方法来退出程序，这可以替代使用kill命令来终止程序进程。使用System.exit()方法会使程序正常退出，而使用kill命令可能会导致程序异常退出或者无法完全终止。因此，建议在Java程序中使用System.exit()方法来退出程序。