当MongoDB的索引查询速度变慢时，可以尝试以下几种解决方法：
优化查询语句：检查查询语句是否能够充分利用现有索引，是否存在不必要的查询操作或者冗余的字段筛选条件。可以通过使用explain()方法来查看查询执行计划，从而分析查询性能瓶颈所在。
创建合适的索引：根据查询需求创建合适的索引，可以使用单字段索引、复合索引或者多键索引来提高查询性能。需要注意的是索引的创建会增加写操作的开销，所以需要权衡读写操作的比例和性能需求。
优化硬件和网络：确保MongoDB所在的服务器硬件足够强大，比如CPU、内存、硬盘等，并且网络连接稳定，避免产生延迟和丢包等问题。
分区和分片：如果数据量巨大，可以考虑使用分区和分片技术来分散负载，提高查询性能。分区将数据划分为多个逻辑分区，而分片则将数据分布到不同的物理节点上。
数据压缩和缓存：可以使用压缩算法对数据进行压缩，减少网络传输和存储开销。同时，可以使用缓存来保存频繁查询的结果，避免重复计算和IO操作。
数据模型优化：根据业务需求和查询特点，优化数据模型设计，避免数据冗余和过度嵌套，合理划分集合和文档结构。
升级版本：如果使用的是较旧的MongoDB版本，可以考虑升级到最新版本，以获得更好的性能和稳定性。
如果以上方法仍不能解决索引查询速度慢的问题，可能需要进行更深入的性能调优和分析，可以使用MongoDB的性能分析工具来识别瓶颈所在，并进行相应的优化。