SSH（Secure Shell）协议是一种加密的网络传输协议，通常用于在不安全的网络环境中提供安全的远程登录和其他安全网络服务。在Java中，有几种最佳应用SSH协议的方式：
- 使用Java SSH库：Java提供了几个SSH库，如JSch和Apache SSHD，这些库允许Java应用程序通过SSH协议连接到远程服务器并执行命令。这些库提供了丰富的API，可以用于创建安全的SSH连接、进行身份验证、执行命令、传输文件等。使用这些库，可以轻松地实现SSH功能，而无需自己从头开始编写代码。
- 使用SSH隧道：SSH隧道是一种通过加密的SSH连接来传输其他网络协议的方法。在Java中，可以使用JSch库或其他SSH库来创建SSH隧道。通过SSH隧道，可以将本地端口转发到远程服务器上的端口，从而使得本地应用程序可以与远程服务器上的应用程序进行通信，就像它们直接连接在一起一样。这对于需要安全地访问远程资源的情况非常有用。
- 使用SSH密钥认证：为了提高安全性，可以使用SSH密钥认证来代替密码身份验证。在Java中，可以使用JSch库或其他SSH库来配置和使用SSH密钥认证。通过使用密钥对进行身份验证，可以避免每次连接时都需要输入密码的麻烦，同时也可以提高连接的安全性。
- 使用SSH多路复用：SSH多路复用是一种在同一SSH连接上同时传输多个协议的方法。在Java中，可以使用JSch库或其他SSH库来支持SSH多路复用。通过使用SSH多路复用，可以在同一连接上同时传输命令、数据和其他协议，从而提高了传输效率和灵活性。
总之，在Java中应用SSH协议的最佳方式是使用成熟的SSH库，如JSch或Apache SSHD，它们提供了丰富的API和支持多种SSH功能。通过使用这些库，可以轻松地实现安全的远程登录、文件传输、端口转发等操作，同时也可以提高应用程序的安全性和效率。