在Java中使用Base64压缩数据时，可以通过以下几种方法来避免数据损失：
使用合适的Base64编码格式：在Java中，有多种Base64编码格式可供选择，包括标准Base64、URL安全Base64和MIME Base64等。根据实际需求选择合适的编码格式，以确保数据不会在编码过程中丢失或损坏。
使用合适的字符集：在对字符串进行Base64编码或解码时，需要指定合适的字符集。通常情况下，UTF-8是一个通用的字符集，可以确保在处理不同类型的数据时不会发生数据损失。
使用适当的数据类型：在压缩数据之前，需要确保数据类型的准确性和完整性。例如，对于文本数据，可以先将其转换为字节数组，然后再进行Base64编码；对于二进制数据，直接进行Base64编码即可。
处理异常情况：在进行Base64压缩时，需要注意异常情况的处理，例如数据为空、数据过长等情况。通过捕获异常并进行适当的处理，可以避免数据损失或程序崩溃的情况发生。
总之，在使用Java进行Base64压缩时，需要谨慎选择编码格式、字符集和数据类型，并注意异常情况的处理，以确保数据在压缩过程中不会出现损失。