在使用JFinal框架集成Mybatis时，需要注意以下几个问题：
- 避免使用Mybatis的自动映射功能：Mybatis的自动映射功能虽然方便，但也可能导致性能问题，因为它会在运行时动态解析和创建对象。建议在需要时手动指定映射关系，以优化性能。
- 分页查询优化：在处理大量数据时，使用分页查询可以避免一次性加载过多数据到内存中，从而提高性能。JFinal的PageHelper插件可以帮助实现分页。
- SQL注入防护：确保所有用户输入都经过适当的验证和转义，避免SQL注入攻击。使用预编译语句（Prepared Statements）是防止SQL注入的有效手段。
- 配置日志记录：配置日志记录以便于调试和监控SQL执行情况。Logback是一个常用的日志框架，可以配置为打印显示SQL语句和执行时间。
- 数据库连接管理：确保数据库连接得到正确释放，避免资源泄露。使用连接池可以有效地管理数据库连接。
- 事务管理：在操作数据库时，确保事务的正确管理，以维护数据的一致性。JFinal和Mybatis都提供了事务管理的功能，需要正确配置和使用。
通过注意以上问题，可以在使用JFinal和Mybatis时确保系统的安全性和性能。