在Linux中配置deploy仓库的方法如下：
打开终端，进入存放项目的目录。
使用git init命令将当前目录初始化为一个Git仓库。
将项目文件添加到仓库中，可以使用git add .命令将所有文件添加，或使用git add <文件名>命令将指定文件添加。
使用git commit -m "<提交信息>"命令提交更改，其中<提交信息>是对此次更改的描述。
创建一个空的bare仓库，可以使用git init --bare <仓库路径>命令创建。
将当前仓库设置为远程仓库，可以使用git remote add origin <远程仓库路径>命令，其中<远程仓库路径>是deploy仓库的路径。
将本地仓库的更改推送到远程仓库，可以使用git push -u origin master命令，其中origin是远程仓库的名称，master是要推送的分支。
完成以上步骤后，你就成功配置了deploy仓库。每次在本地仓库提交更改后，可以使用git push命令将更改推送到远程仓库，从而将项目部署到服务器上。