Tomcat与PHP的兼容性问题主要包括以下几个方面：
语言差异：Tomcat是一个Java Servlet容器，而PHP是一种脚本语言。两者的语法和用法有很大的不同，因此在将PHP应用部署到Tomcat时可能会出现一些兼容性问题。
配置问题：Tomcat主要用于部署Java应用，因此默认情况下不支持PHP。要在Tomcat上运行PHP应用，需要进行一些额外的配置，包括安装PHP解释器和配置Tomcat的Servlet容器来解析PHP文件。
性能问题：Tomcat是为Java应用而设计的，因此在运行PHP应用时可能会出现性能损失。PHP的执行效率通常比Java要低，因此在Tomcat上运行PHP应用可能会导致性能下降。
依赖问题：PHP应用通常依赖于一些特定的PHP扩展和库，而这些扩展和库可能与Tomcat的环境不兼容。因此在将PHP应用部署到Tomcat时，需要确保相关的依赖项都能正确安装和配置。
综上所述，虽然可以在Tomcat上运行PHP应用，但需要克服一些兼容性问题。如果可能，推荐使用专门为PHP应用设计的Web服务器，如Apache或Nginx。