文件系统的权限控制：VFAT文件系统不支持Linux的权限控制机制，因此无法对文件和目录进行精细的权限控制。这意味着所有用户都可以访问和修改VFAT分区上的文件，这可能会增加数据泄霎和病毒感染的风险。
文件系统的稳定性：由于VFAT是一种较为简单的文件系统，不支持一些高级功能如日志记录和数据恢复，因此在出现断电或系统崩溃等情况时，数据容易丢失或损坏。
大文件支持：VFAT文件系统对单个文件的大小有限制，通常为4GB，因此无法用于存储大型文件，如高清影片或虚拟机镜像等。
文件名的支持：VFAT文件系统对文件名的字符和长度有一定的限制，不支持Linux系统中的所有字符和长度，可能导致一些文件无法正常保存或访问。
兼容性：虽然VFAT文件系统在Windows和Linux系统下都有很好的兼容性，但在跨平台使用时可能会出现一些兼容性问题，如文件名的大小写敏感等。
总的来说，虽然VFAT文件系统在某些方面有一定的安全性和稳定性问题，但对于一般用户来说，只要注意数据备份和避免存储重要数据在VFAT分区上，通常情况下使用VFAT文件系统并不会有太大的安全隐患。