Spring Boot集成MyBatis的原理是通过使用Spring Boot提供的自动配置机制，自动配置MyBatis相关的组件，并将其注册到Spring容器中。
具体来说，Spring Boot会扫描classpath下的所有MyBatis的相关依赖，例如mybatis-spring、mybatis-spring-boot-starter等，然后根据这些依赖自动配置MyBatis的相关组件。
自动配置的过程中，Spring Boot会根据配置文件或者注解中的配置，自动创建和配置一个SqlSessionFactory实例，该实例负责管理MyBatis的会话和映射器。
同时，Spring Boot还会自动创建和配置一个SqlSessionTemplate实例，该实例是MyBatis的核心类，用于执行SQL语句和管理会话。
另外，Spring Boot还会自动创建和配置一个MapperScannerConfigurer实例，该实例用于扫描指定的包路径，自动注册MyBatis的Mapper接口到Spring容器中。
最后，Spring Boot还提供了一些默认的配置，例如数据库连接配置、事务管理等，这些默认配置可以通过配置文件或者注解进行自定义。
总之，Spring Boot集成MyBatis的原理是通过自动配置机制，自动创建和配置MyBatis的相关组件，并将其注册到Spring容器中，使得开发者可以方便地使用MyBatis进行数据库操作。