CentOS下Compton与Wayland通常是兼容的。Compton原生支持Wayland协议，可在GNOME 3等Wayland桌面环境下正常运行。
不过，可能存在一些兼容性问题，如在Wayland环境下使用OBS Studio等录屏软件时可能出现问题。此外，如果使用的是较旧的CentOS版本或特定硬件配置，也可能遇到兼容性方面的挑战。