在CentOS系统上，C++代码的加密保护可以通过多种方法实现，以下是一些常见的方法：
代码混淆：通过改变代码结构和逻辑来增加反编译难度。可以使用专门的工具如Obfuscator-LLVM来实现代码混淆。
加壳工具：使用加壳工具如PEConvert将编译后的二进制文件加壳，这样可以防止或增加反病毒软件的检测难度。
第三方保护工具：可以考虑使用专门的软件保护和加壳工具，如SmartAssembly等，这些工具能够在编译阶段自动嵌入版权信息、加壳保护，并提供额外的反调试和防篡改功能。
加密源代码：将源代码加密，并在运行时解密。这要求开发者使用特定的编译器插件或工具，在编译时对源代码进行加密处理。
动态链接库（DLL）或共享对象（SO）：将关键代码封装在动态链接库中，并在运行时动态加载，这样可以增加代码的保护级别。
实施严格的访问控制：通过配置文件权限和用户权限，限制对敏感代码的访问，可以有效防止未经授权的访问。
定期更新和修补系统：保持系统和开发环境的最新状态，及时应用安全补丁，可以减少安全漏洞，提高系统的整体安全性。
需要注意的是，没有任何方法可以提供绝对的安全保障，因此建议结合多种策略，并持续关注最新的安全动态和工具，以应对潜在的安全威胁。