总体结论
在 Ubuntu 上，Compton 作为 X11 的窗口合成器，确实可能与部分桌面组件、特效或应用产生冲突；但在 Openbox、i3 等轻量 WM 下通常运行稳定。常见冲突集中在 GNOME、KDE 等自带合成/特效栈的环境，以及硬件加速、库版本和配置不当等场景。若遇到难以定位的问题，可考虑使用维护更活跃的替代方案 picom。
常见冲突场景
- 与桌面环境自带合成器或特效的叠加：在 GNOME、KDE 等环境中同时启用合成器，易出现重绘、撕裂、阴影/透明异常或性能下降，通常建议只保留一个合成器。
- 动态库与依赖差异：libxrender、libglx 等库版本不一致，可能导致无法启动、崩溃或渲染异常。
- 配置路径与参数不当：配置文件位置（如 ~/.config/compton.conf 或 /etc/xdg/compton.conf）与启动参数不匹配，或未针对硬件选择合适后端（如 glx/xrender），会引发兼容性与性能问题。
- 特定应用/功能的互操作问题：如与屏幕边缘切换、窗口管理动作、屏保/锁屏等组件的交互异常，需要按应用逐项调整规则或禁用相关特效。
规避与解决建议
- 单合成器原则：在 GNOME/KDE 等环境中，优先使用其自带合成器；如使用 Compton，请先关闭桌面自带合成/特效以避免叠加冲突。
- 选对后端与简化特效：优先尝试 backend glx；若出现花屏/卡顿，切换 xrender 并适当关闭 shadow、blur、opacity 等开销较大的特效以换取稳定性。
- 正确安装与配置：通过包管理器安装并保持依赖完整；将配置写入 ~/.config/compton.conf 或 /etc/xdg/compton.conf，必要时在 ~/.xprofile 或 ~/.xinitrc 中配置启动参数，变更后重启 Compton 生效。
- 调试与回退：通过日志与逐项禁用特效定位问题；若持续不稳定，直接卸载 Compton 或迁移到 picom 等替代方案。
快速排查步骤
- 检查是否已有合成器在运行：执行 ps aux | grep -iE “compton|kwin|mutter|gnome-shell”，避免多合成器并存。
- 查看与调整配置：确认 ~/.config/compton.conf 或 /etc/xdg/compton.conf 存在且参数合理；必要时先用最小化配置验证。
- 切换后端并重启：在配置中尝试 backend glx 或 xrender，保存后执行 killall compton && compton & 观察是否恢复正常。
- 针对问题应用做例外：为出现问题的应用编写规则（如关闭阴影/模糊/透明度），减少互操作冲突。
- 仍不稳定时：卸载 Compton 或改用 picom，通常可获得更好的兼容性与维护支持。