Debian与JSP集成的难点主要包括以下几个方面：
环境配置：在Debian上配置JSP环境需要安装Java开发工具包（JDK）和Tomcat服务器。这涉及到下载和安装JDK，设置环境变量，以及安装和配置Tomcat。
权限问题：确保文件所有权和权限正确设置，特别是在安装和配置过程中，需要保证Tomcat用户对Tomcat目录有适当的权限。
依赖管理：在集成过程中可能会遇到依赖缺失的问题，需要在control文件中通过Depends字段声明所有必要的依赖。
模块集成：将Apache HTTP Server与Tomcat集成，通常需要安装和配置mod_jk模块，以便Apache能够转发请求到Tomcat。
安全性配置：为了提高系统的安全性，需要确保Tomcat用户没有root权限，并且在配置文件中设置适当的安全选项。
常见问题解决：在集成过程中可能会遇到各种问题，如打包失败、安装测试失败等，需要根据具体错误信息进行排查和解决。
系统兼容性：确保所有软件版本兼容，特别是在升级或降级软件版本时，可能会遇到兼容性问题。
性能优化：对Tomcat进行性能调优，以满足高并发访问的需求。
日志管理：配置日志系统，以便于监控和排查问题。
备份与恢复：建立有效的备份和恢复机制，以防数据丢失或系统故障。
请注意，以上信息仅供参考，具体的集成步骤和难点可能会因不同的系统和配置而有所不同。在实际操作中，建议参考官方文档和相关社区资源，以确保集成的顺利进行。