在Spring Boot中配置多数据源需要以下步骤：
1. 引入所需的依赖：在pom.xml文件中添加spring-boot-starter-data-jpa和相应的数据库驱动依赖。
2. 配置数据源1：在application.properties或application.yml中配置第一个数据源的相关属性，如数据库URL、用户名、密码等。
3. 创建第一个数据源的配置类：创建一个配置类，使用@Configuration注解标识，并使用@EnableJpaRepositories注解指定JPA仓库接口的扫描路径。
4. 配置数据源2：在application.properties或application.yml中配置第二个数据源的相关属性。
5. 创建第二个数据源的配置类：创建一个配置类，使用@Configuration注解标识，并使用@EnableJpaRepositories注解指定JPA仓库接口的扫描路径。
6. 创建两个数据源的实体类和JPA仓库接口。
7. 使用@Qualifier注解指定要使用的数据源：在需要使用数据源的地方使用@Qualifier注解指定要使用的数据源，如在JPA仓库接口上指定。
以上是使用JPA配置多数据源的基本步骤，具体操作可以参考Spring Boot官方文档或相关教程。