在Linux系统中，mkdir命令用于创建新的目录。创建目录时，会根据当前用户的文件权限来确定新目录的权限设置。具体来说，新创建的目录的权限将取决于当前用户对父目录的权限设置。
如果当前用户对父目录具有写权限，则可以使用mkdir命令创建新的子目录。新目录的权限将继承父目录的权限设置。例如，如果父目录的权限为drwxr-xr-x，则新创建的子目录的权限也会设置为drwxr-xr-x。
如果当前用户对父目录没有写权限，则无法在该目录下创建新的子目录。在这种情况下，可以尝试切换到具有写权限的目录下再使用mkdir命令创建新的目录。
总之，mkdir命令与文件权限的关系是：新创建的目录的权限将取决于当前用户对父目录的权限设置。