Spring Boot可以通过在application.properties文件中指定自定义properties文件的路径来读取自定义properties文件。首先，在application.properties文件中添加以下配置：
custom.properties.location=file:/path/to/your/custom.properties
然后在应用程序中使用@PropertySource注解指定自定义properties文件的路径：
@PropertySource("file:${custom.properties.location}")
这样Spring Boot就会在启动时加载自定义properties文件，并可以通过@Value注解或Environment对象来读取自定义properties文件中的配置。