在Debian系统下优化MongoDB的存储空间，可以从以下几个方面进行：
压缩数据文件：
MongoDB支持使用compact命令来压缩数据库文件，减少磁盘空间的占用。
mongo --eval 'db.runCommand({compact: "yourDatabaseName"})'
删除不必要的索引： 过多的索引会占用大量存储空间，定期检查和删除不再使用的索引。
db.collection.getIndexes()
db.collection.dropIndex("indexName")
归档旧数据： 对于历史数据，可以考虑将其归档到其他存储系统（如HDFS、S3等），然后在MongoDB中删除这些数据。
选择合适的存储引擎： MongoDB支持多种存储引擎，如WiredTiger、MMAPv1等。WiredTiger是默认的存储引擎，它在性能和存储效率方面都有不错的表现。
调整WiredTiger缓存大小：
WiredTiger使用内存作为缓存，可以通过调整storage.wiredTiger.engineConfig.cacheSizeGB参数来控制缓存大小。
storage:
wiredTiger:
engineConfig:
cacheSizeGB: 4
调整日志级别： 减少日志的输出量可以节省磁盘空间。
systemLog:
verbosity: 1
定期清理日志文件： MongoDB会自动管理日志文件的生命周期，但也可以手动删除旧的日志文件。
使用SSD： SSD相比HDD具有更快的读写速度和更低的延迟，可以显著提高MongoDB的性能和存储效率。
增加内存： 增加服务器的内存可以提高WiredTiger缓存的效率，减少磁盘I/O。
执行repairDatabase命令：
定期执行repairDatabase命令可以修复数据库中的损坏数据，但请注意这会锁定数据库一段时间。
mongo --eval 'db.repairDatabase()'
监控磁盘使用情况：
使用工具如df -h和du -sh定期检查磁盘使用情况，及时发现并处理存储空间不足的问题。
journal设置：
如果不需要事务支持，可以关闭journal以节省磁盘空间。storage:
journal:
enabled: false
通过以上这些方法，可以在Debian系统下有效地优化MongoDB的存储空间。根据具体的使用场景和需求，选择合适的优化策略。