Debian与PHPStorm的兼容性问题通常不大，但也可能遇到一些问题，具体如下：
- 系统要求方面：PhpStorm要求安装Java运行环境，Debian系统需先安装OpenJDK或Oracle JDK，不过安装过程较为简单。
- 版本匹配方面：需确保Debian系统中的PHP版本与PhpStorm支持的版本一致，同时要保证PHP扩展如GD库等与PHP版本兼容，并正确配置php.ini文件。
- 配置文件方面：要正确配置Web服务器（如Apache或Nginx）的相关参数，以及在PhpStorm中设置正确的PHP解释器路径、服务器地址等。