.NET Framework 2.0和3.5之间有以下几点区别：
功能增强：.NET Framework 3.5在2.0的基础上增加了一些新的功能和特性，包括LINQ（Language Integrated Query）、WCF（Windows Communication Foundation）、WPF（Windows Presentation Foundation）等。这些功能增强了开发人员的编程效率和程序性能。
兼容性：.NET Framework 3.5是2.0的更新版本，因此可以向下兼容2.0的应用程序。这意味着用.NET Framework 2.0编写的应用程序可以在3.5上运行，但是反过来不一定成立。
安全性：.NET Framework 3.5在2.0的基础上增加了一些新的安全功能，提高了应用程序的安全性。
性能：.NET Framework 3.5相对于2.0在性能上有所提升，但是提升并不会很显著。开发人员在选择版本时可以根据具体的需求和应用场景进行选择。