Java与ELK Stack（Elasticsearch、Logstash、Kibana）的安全集成方案可以通过以下几种方式来实现：
使用SSL/TLS加密通信：为Java应用程序和ELK Stack之间的通信配置SSL/TLS加密，确保数据在传输过程中是安全的。可以为Elasticsearch和Kibana配置SSL/TLS证书，以确保与Java应用程序的通信是加密的。
使用认证和授权机制：在Elasticsearch和Kibana中配置认证和授权机制，以确保只有经过验证的用户可以访问应用程序生成的日志数据。可以使用基本身份验证、LDAP、Active Directory等认证方式，并配置角色和权限控制。
配置防火墙和网络安全规则：在部署ELK Stack的服务器上配置防火墙和网络安全规则，以限制对Elasticsearch和Kibana的访问。只允许必要的端口和IP地址访问ELK Stack的服务。
监控和日志审计：配置ELK Stack的日志审计功能，记录用户的操作和访问日志。通过监控和分析这些日志数据，可以及时发现异常行为并采取相应的安全措施。
定期更新和维护：定期更新Elasticsearch、Logstash和Kibana的版本，以及相关的安全插件和补丁程序，确保系统的安全性和稳定性。
综上所述，通过以上安全集成方案可以有效保护Java应用程序与ELK Stack之间的通信安全，并确保日志数据的机密性和完整性。