在Matplotlib中，可以使用`legend`函数来设置图例的标记颜色。具体步骤如下：
1、首先创建一个图形并添加图例，例如：
```python
import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot([1, 2, 3, 4], [1, 4, 9, 16], label='Data')
plt.legend()
```
2、接下来可以使用`legend`函数的`get_legend_handles_labels`方法获取图例的句柄和标签，然后遍历句柄并设置标记颜色，例如：
```python
handles, labels = plt.gca().get_legend_handles_labels()
for handle in handles:
handle.set_color('red') # 设置标记颜色为红色
```
3、最后需要调用`plt.show()`方法显示图形和图例，完整代码如下：
```python
import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot([1, 2, 3, 4], [1, 4, 9, 16], label='Data')
plt.legend()
handles, labels = plt.gca().get_legend_handles_labels()
for handle in handles:
handle.set_color('red') # 设置标记颜色为红色
plt.show()
```