C# WebAPI和MVC都是用于构建Web应用程序的技术，但它们有一些区别：
MVC（Model-View-Controller）是一种设计模式，用于组织代码并分离应用程序的数据模型、视图和控制器。MVC框架是一种用于构建Web应用程序的模式，并且在C#中可以使用ASP.NET MVC框架来实现。MVC通常用于构建传统的Web应用程序，包括使用视图和控制器来生成HTML页面。
WebAPI是用于构建RESTful Web服务的技术，它提供了一种轻量级的方式来构建HTTP服务，通常用于构建基于HTTP的API。WebAPI允许开发人员构建应用程序可以通过HTTP协议与客户端进行通信的Web服务。在C#中，可以使用ASP.NET Web API来实现RESTful Web服务。
因此，主要区别在于MVC用于构建传统的Web应用程序，而WebAPI用于构建RESTful Web服务。另外，MVC通常用于生成HTML页面，而WebAPI用于处理HTTP请求并返回数据。