在Linux系统中，Node.js的依赖项可以通过npm（Node Package Manager）或yarn来管理。以下是使用这两种工具管理依赖项的方法：
使用npm管理依赖项：
a. 初始化项目：在项目根目录下运行npm init命令，按照提示填写信息，生成package.json文件。这个文件用于记录项目的元数据和依赖关系。
b. 安装依赖项：使用npm install <package_name> --save命令安装依赖项，--save参数会将依赖项添加到package.json文件的dependencies中。例如：npm install express --save。
c. 安装开发依赖项：使用npm install <package_name> --save-dev命令安装开发依赖项，--save-dev参数会将依赖项添加到package.json文件的devDependencies中。例如：npm install nodemon --save-dev。
d. 查看已安装的依赖项：使用npm list命令查看项目中已安装的所有依赖项。
e. 更新依赖项：使用npm update <package_name>命令更新指定依赖项。例如：npm update express。
f. 删除依赖项：使用npm uninstall <package_name>命令删除指定依赖项。例如：npm uninstall express。
使用yarn管理依赖项：
a. 安装yarn：访问Yarn官网（https://yarnpkg.com/）下载并安装适用于Linux系统的Yarn。
b. 初始化项目：在项目根目录下运行yarn init命令，按照提示填写信息，生成package.json文件。
c. 安装依赖项：使用yarn add <package_name>命令安装依赖项，会将依赖项添加到package.json文件的dependencies中。例如：yarn add express。
d. 安装开发依赖项：使用yarn add <package_name> --dev命令安装开发依赖项，会将依赖项添加到package.json文件的devDependencies中。例如：yarn add nodemon --dev。
e. 查看已安装的依赖项：使用yarn list命令查看项目中已安装的所有依赖项。
f. 更新依赖项：使用yarn upgrade <package_name>命令更新指定依赖项。例如：yarn upgrade express。
g. 删除依赖项：使用yarn remove <package_name>命令删除指定依赖项。例如：yarn remove express。
通过以上方法，你可以在Linux系统中使用npm或yarn来管理Node.js项目的依赖项。