Linux系统命令是操作系统提供的可直接执行的程序，用于完成特定的任务或操作。Shell脚本是一种脚本语言，用于编写一系列的命令，实现自动化任务的目的。区别如下：
执行方式：Linux系统命令可以直接在终端中输入执行，也可以在Shell脚本中调用；而Shell脚本需要在终端中执行，或者通过定时任务等方式自动执行。
功能：Linux系统命令是一个完整的程序，通常只实现一个具体的功能或操作；而Shell脚本可以包含多个命令，用于实现复杂的任务或操作。
可读性：Shell脚本相对于Linux系统命令更易于阅读和维护，可以通过脚本中的注释和结构来理解脚本的功能和逻辑。
灵活性：通过Shell脚本可以灵活地组合和调用多个命令，实现更加复杂和定制化的任务；而Linux系统命令通常只能执行特定的功能。
总的来说，Linux系统命令是单个命令的集合，用于完成特定的任务；而Shell脚本是由多个命令组成的脚本文件，用于实现更复杂的任务或操作。