在PHP配置文件中，可以通过设置一些安全选项来加强系统的安全性。以下是一些常见的安全设置：
关闭错误报告：可以通过设置display_errors为Off来禁止在页面中显示PHP错误信息，防止将敏感信息暴露给用户。
禁止远程文件包含：通过设置allow_url_fopen为Off，可以防止应用程序通过URL包含外部文件，减少安全风险。
关闭危险函数：通过disable_functions设置禁用一些危险的PHP函数，如exec、system等，避免恶意代码执行。
文件上传限制：通过设置upload_max_filesize和post_max_size限制文件上传大小，避免恶意上传大文件造成服务器资源被耗尽。
开启安全模式：通过设置safe_mode为On，可以限制脚本的访问权限，避免一些危险的操作。
设置安全目录：通过设置open_basedir限制PHP脚本的访问范围，防止脚本越权访问系统文件。
防止SQL注入：通过使用预处理语句或者转义输入数据，可以防止SQL注入攻击。
防止跨站脚本攻击（XSS）：在输出用户输入内容时，使用htmlspecialchars()函数对内容进行转义，避免XSS攻击。
定期更新PHP版本：及时更新PHP版本可以修复已知的漏洞，提高系统的安全性。